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磁共振成像的图画与CT图画十分相似，二者都是“数字图画”，并以不同灰度闪现不同结构的解剖和病理的断面图画。与CT相同，MRI监护仪也几乎适用于全身各系统的不同疾病，例如肿瘤、炎症、伤口、退行性病变，以及各种先天性疾病等的检查。
磁共振成像无骨性伪影，可随意作直接的多方向（横断、冠状、矢状或任何角度）切层，对颅脑、脊柱和脊髓等的解剖和病变的闪现，尤优于CT，磁共振成象借其“流空效应”，可不用血管造影剂，闪现血管结构，故在“无损伤”地闪现血管（细小血管在外），以及对肿块、淋巴结和血管结构之间的相互辨别方面，有独到之处。
磁共振成像有高于CT数倍的软组织分辩才能，它能灵敏地检出组织成分中水含量的改动，故常可比CT更有用和前期地发现病变。通过磁共振血流成像技术的研讨获得的进展，使在活体上测定血流量和血流门控的使用，使磁共振成像能清楚地、全面地闪现心脏、心肌、心包以及心内的其他纤细结构，为无损地检查和确诊各种获得性与先天性心脏疾患（包括冠心病等），以及心脏功用的检查，提供了可靠的方法。跟着各种不同的快速扫描序列和三维取样扫描技术的研讨和成功地应用于临床，磁共振血管造影和电影拍照新技术已步入临床，且日臻完善。又完成了磁共振成像和部分频谱学的结合（即MRI与MRS的结合），以及除氢质子以外的其他原子核如氟、钠、磷等的磁共振成像，这些效果将能更有用地进步磁共振成像确诊的特异性，也开阔了它的临床用处。
磁共振成像术的主要缺少，在于它扫描所需的时间较长，因而对一些不合作的患者的检查常感困难，对运动性器官，例如胃肠道因缺少适宜的比照剂，常常闪现不清楚；关于肺部，因为呼吸运动以及肺泡内氢质子密度很低一级原因，成像作用也不满意。磁共振成像对钙化灶和骨骼病灶的闪现，也不如CT确和灵敏。磁共振成像术的空间分辩室，也有待进一步进步。
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